Sejarah Desa Ngawun tidak terlepas dari sejarah Masyarakat (SUKU) Jawa di Kabupaten Tuban. Pada zaman Belanda Desa Ngawun terbagi dalam dua wilayah terdiri dari wilayah kekuasaan Jagal abilowo dan wilayah kekuasaan Prabu joko.Kedua penguasa saling bertentangan.Akirnya terjadi peperangan kedua belah pihak yang sama-sama saktinya dan akhirnya sama-sama mengalah (istilah Jawa Ngawon).Dengan kemajuan zaman akhirnya menjadi Ngawun.

Sejak tahun 1871-1891 di pimpin oleh Kariman,Tahun 1891-1911 di Pimpin oleh Sampan,Tahun 1911-1931 di pimpin oleh Kardiman,Tahun 1931-1951 di Pimpin Mulani,Tahun 1951-1991 di pimpin oleh Soepardji,Tahun 1991-1999 di pimpin oleh Wiji,Tahun 1999-2007 di pimpin oleh Winarti,Tahun 2007-2013 di pimpin Pardi,Tahun 2013 hingga sekarang adalah Darmoko.